Dans une association où, d’après les statuts, le président change tous les ans sauf dans des circonstances historiques exceptionnelles, les secrétaires sont amenés à jouer un grand rôle.
1868-1915 Michel BRÉAL
1916-1936 Antoine MEILLET
1937-1958 Joseph VENDRYÈS
1959-1970 Émile BENVENISTE
1971-1978 Michel LEJEUNE
1979-1999 Jean PERROT
2000-2017 Alain LEMARÉCHAL
2018- Daniel PETIT
À l’exception de Michel BRÉAL, tous ont été également secrétaires-adjoints. Ferdinand de Saussure a exercé cette dernière fonction de 1883 à 1891.
1864-1865 A. D’ABBADIE
1866 Emile EGGER
1867 Ernest RENAN
1868 Wi. BRUNET DE PRESLE
1869 F. BAUDRY
1870-71 Émile EGGER
1872 Charles THUROT
1873 Gaston PARIS
1874 Charles PLOIX
1875 L. VAÏSSE
1876 Émile EGGER
1877 Eugène BENOIST
1878 Robert MOWAT
1879 Abel BERGAIGNE
1880 G. MASPÉRO
1881 H. GAIDOZ
1882 Louis LEGER
1883 D’ARBOIS DE JUBAINVILLE
1884 Stanislas GUYARD
1885 H. DE CHARENCEY
1886 Rubens DUVAL
1887 James DARMESTETER
1888 Joseph HALEVY
1889 Charles PLOIX
1890 F. BONNARDOT
1891 M. DE ROCHEMONTEIX
1892 Phillippe BERGER
1893 Sylvain LÉVI
1894 Alexandre BIBESCO
1895 Jean-Pierre ROUSSELOT
1896 Jean PSICHARI
1897 Alexandre BOUTROUE
1898 Paul LEJAY
1899 Th. PARMENTIER
1900 Ch. ROSAPEILLY
1901 Paul BOYER
1902 Charles JORET
1903 Clément HUART
1904 Alexandre LIETARD
1904 Antoine THOMAS
1905 Théodore REINACH
1906 GAUDEFROY-DEMOMBYNES
1907 F. BRUNOT
1908 L. SAINÉAN
1909 Théophile CART
1910 LOUIS FINOT
1911 H. PERNOT
1912 J. LOTH
1913 Gabriel FERRAND
1914-1915 LÉVY-BRUHL
1916 Paul LEJAY
1917 Paul BOYER
1918 Clément HUART
1919 Jean PSICHARI
1920 Jean DENY
1921 Oscar BLOGH
1922 Daniel BARBELENET
1923 Maurice DELAFOSSE
1924 William MARÇAIS
1925 Paul PELLIOT
1926 André MAZON
1927 Jules MAROUZEAU
1928 Paul RIVET
1929 Henri YVON
1930 Henri MASPÉRO
1931 Ernest TONNELAT
1932 Georges LACOMBE
1933 Émile BOURGUET
1934 Gustave GUILLAUME
1935 Edmond DESTAING
1936 André VAILLANT
1937 Georges COLIN
1938 James FÉVRIER
1939 Léon BEAULIEUX
1940-44 Lilias HOMBURGER
1945 Fernand MOSSÉ
1946 Pierre CHANTRAINE
1947 André BASSET
1948 Jean HUMBERT
1949 Marc VEY
1950 Aurélien SAUVAGEOT
1951 Jean CANTINEAU
1952 Jules BLOCH
1953 Alfred ERNOUT
1954 Léon WAGNER
1955 Georges GOUGENHEIM
1956 Paul DEMIÉVILLE
1957 André MIRAMBEL
1958 Michel LEJEUNE
1959 Pierre MEILE
1960 Jean FOURQUET
1961 Marguerite DURAND
1962 André MARTINET
1963 Armand MINARD
1964 François MARTINI
1965 Emmanuel LAROCHE
1966 Paul IMBS
1967 André-Georges HAUDRICOURT
1968 René LAFON
1969 Bernard POTTIER
1970 Étienne DECAUX
1971 Louis BAZIN
1972 Gilbert LAZARD
1973 René L’HERMITTE
1974 Claude MARGUERON
1975 David COHEN
1976 Jacques FAUBLÉE
1977 Lionel GALAND
1978 Raymond SINDOU
1979 Claude GOUFFÉ
1980 Claude HAGÈGE
1981 Yves MILLET
1982 Claudie TCHEKOFF
1983 Yves MILLET
1984 Georges CHARACHIDZÉ
1985 Serge SAUVAGEOT
1986 Denise BERNOT
1987 Antoine CULIOLI
1988 Catherine PARIS
1989 Guy SERBAT
1990 Alice CARTIER
1991 Maurice COYAUD
1992 Alphonse LEGUIL
1993 Irina FOUGERON
1994 Luc BOUQUIAUX
1995 Pascal VERNUS
1996 Françoise BADER
1997 Gilbert LAZARD
1998 Françoise MADRAY
1999 Emilio BONVINI
2000 Mary-Annick MOREL
2001 André ROUSSEAU
2002 Claire BLANCHE-BENVENISTE
2003 Jean BREUILLARD
2004 Andrée BORILLO
2005 Marc BARATIN
2006 Gaston GROSS
2007 Zlatka GUENTCHEVA
2008 Pierre COTTE
2009 Martine VANHOVE
2010 Alain ROUVERET
2011 Anaïd DONABEDIAN
2012 Claire MOYSE-FAURIE
2013 Alain KIHM
2014 Jean-Pierre DESCLES
2015 Michèle FRUYT
2016 Annie RIALLAND
2017 Jacques FRANÇOIS
2018 Bernard BORTOLUSSI